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Contexte et objectif du stage : Incertitudes dans les mesures « macrophytes en cours d’eau » :
évaluation de la variabilité stationnelle, propagation des erreurs de relevé dans les indicateurs d’état
écologique.
L’évaluation des sources d’incertitude dans les mesures hydrobiologiques est rendue nécessaire par les prescriptions de maitrise de la confiance d ans l’évaluation de l’état écologique au sens de la surveillance en réseaux DCE. Un programme de recherche méthodologique est engagé par l’équipe
CARMA sur l’évaluation expérimentale de ces incertitudes, pour les protocoles Diatomées et Macrophytes en cours d’eau.
La dernière phase de ce programme triennal, en 2015, concernera la variabilité stationnelle et les
approches de propagation des erreurs dans le calcul des indicateurs. Le travail s’intéressera à deux aspects méthodologiques contribuant à l’identification et à l’estimation des sources d’incertitudes :
1- la mesure de la variabilité induite dans les résultats du protocole de relevé IBMR (norme NF T-
90-395), issue du patron de distribution des peuplements de macrophytes. Cette approche sera menée sur un panel de 5 stations, sur lesquelles un relevé par tranche de 10 à 50 m permettra d’acquérir des données séquentielles pour des tests de variabilité (richesse, composition, impact
sur les métriques) sur des linéaires de 100 m reconstitués
2- L’évaluation des erreurs de détermination taxonomique et la propagation de l’incertitude induite
dans la chaine d’évaluation de l’état écologique, au sens DCE. Un référentiel de taux potentiel de
confusion entre les taxons sera constitué. Cette matrice sera utilisée pour engager des simulations d’erreurs sur l’ensemble des données d’une BDD de portée nationale et analyser leur propagation dans plusieurs métriques d’évaluation.
Etudiant(e) en Master 2 ou école d’ingénieur, orientation biologie/écologie/gestion des milieux
aquatiques. Intérêt et motivation pour le travail sur bases de données, l’exploitation de données, les
opérations de terrain (relevés macrophytes). Posséder les connaissances de base en écologie des
cours d’eau et écologie végétale aquatique est un avantage. Capacité de recherche et de synthèse documentaire (en français et en anglais), capacité à travailler de manière autonome et en équipe. Au cours de ce travail, le(la) stagiaire acquerra des capacités en gestion et traitement de données par requêtes SQL et implémentation de codes R.
Quelques déplacements à prévoir hors région Aquitaine (relevés sur sites), avec les ingénieurs Irstea en charge de l’étude..
Modalités :
• Lettre de motivation et curriculum vitae détaillé à envoyer via le formulaire ci-dessous.
• Indemnité de stage (tiers du SMIC). Convention entre l’organisme de formation et Irstea-Bordeaux.
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