Description du poste

Irstea, institut national de recherche en sciences et technologies pour l’environnement et l'agriculture est focalisé sur 3 défis sociétaux : la gestion durable des eaux et des territoires, les risques naturels et la qualité environnementale. Bien inséré dans le paysage de la recherche française et européenne, il mène ses recherches en appui aux politiques publiques et en partenariat
avec les industriels. Il comprend 1600 personnes sur 9 sites en France.

Vous intégrerez l’unité de recherche RECOVER, au sein de l'équipe FRESHCO, qui est constituée d'une trentaine de personnes. Elle développe des connaissances sur la biodiversité, le fonctionnement des écosystèmes lentiques et des outils dédiés à la gestion des milieux aquatiques (diagnostic restauration). Elle associe des scientifiques ayant des compétences en hydrobiologie, limnologie, écologie des communautés, géomatique, statistique et modélisation.
L’axe de recherche de l’équipe vise à mieux comprendre le comportement des poissons, ainsi que les facteurs biotiques et abiotiques qui orientent les choix d'habitats sous contraintes anthropiques. Vous apporterez votre expertise en analysant des données de sondeur split-beam en relation avec la distribution spatiale des communautés piscicoles et d’individus marqués à l’aide de marques électroniques.

Les communautés de poissons vivants dans les milieux aquatiques d'origine anthropique sont très dépendants des conditions environnementales qui varient fortement au cours du temps. Tout d’abord, des recherches ont été menées dans le lac de barrage des Bariousses, sur l'impact des fluctuations des conditions du milieu sur les communautés de poissons au niveau de l'individu en suivant au cours du temps plus de 90 poissons marqués à l'aide de marques électroniques. Parallèlement, lors d'un
suivi établi sur un cycle nycthéméral, la distribution spatiale du peuplement de poisson a été approchée par hydroacoustique (échosondage), afin de mettre en évidence les relations du comportement individuel contre la distribution du peuplement. Cette approche actuellement très peu répandue, couple deux méthodes, les marquages individuels et l’hydroacoustique, et permettra de valider l’accessibilité (ou non) des espèces à l'échantillonnage par hydroacoustique et la représentativité des estimations faites par échosondage. La répartition spatiale des individus, espèce par espèce, sera décrite lors des périodes où les parcours d’échosondage ont été réalisés. Cette étude permettra ainsi de vérifier si les individus de chaque espèce sont accessibles (détectables) ou non à l’échosondage et ce pour chaque période (nuit, jour, crépuscule, aube). Les résultats exprimés en
pourcentage de détectabilité par espèce, permettront d'approcher la capacité ou non des données issues de l’échosondage et de donner accès à des informations sur le peuplement dans son entier.

Dans le cas contraire, cela permettra de mettre en évidence la proportion du peuplement non détecté selon la période et de conclure sur la nécessité de prendre en compte l’écologie, le comportement des poissons dans la mise en place des stratégies d’échantillonnage.

Ce travail sera complété avec l'étude du positionnement individuel des poissons marqués et celui des communautés détectées par hydroacoustique afin de vérifier les relations prédateurs/proies (les proies seront principalement les juvéniles, accessibles par les distributions en tailles des poissons détectés). Enfin, les cibles individuelles marquées et les cibles détectées par échosondage seront positionnées spatialement par rapport à la nature des substrats des fonds dans les zones profondes, qui a été déterminée à l'aide du système RoxAnn.
Votre mission sera d’analyser les données hydroacoustiques et de les mettre en relation avec les données sur les poissons marqués individuellement.