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Chercheur en écotoxicologie H/F

Publiée le 18/07/2016

Description du poste

Irstea, institut de recherche en sciences et technologies pour l’environnement et l’agriculture est focalisé sur 3 défis sociétaux: la gestion durable des eaux et des territoires, les risques naturels et la qualité environnementale. Bien inséré dans le paysage de la recherche française et européenne, il mène ses recherches en appui aux politiques publiques et en partenariat avec les industriels. Il comprend 1600 personnes sur 9 sites en France.

L’unité de recherche Milieux Aquatiques, Ecologie et Pollutions (MAEP ou MALY) du Centre de Lyon-Villeurbanne | Irstea est constituée d’équipes travaillant sur des questions de qualité biologique et chimique et de fonctionnement des milieux aquatiques d’eau douce (biologie, écologie, écotoxicologie, chimie analytique et environnementale, devenir et transferts des substances chimiques, traitement des eaux usées). Dans le cadre de la programmation scientifique du thème de recherche Belca, l'équipe d’écotoxicologie développe ses activités sur le transfert et l’impact de la contamination chimique chez les organismes et les populations aquatiques d’eau douce. Les objectifs de l’équipe concernent la production de connaissances, de méthodes et d’outils pour la caractérisation du danger toxique des polluants chimiques pour les organismes et leurs populations ainsi que pour le diagnostic de la contamination et de son impact dans les milieux.

Votre profil s’inscrit dans une dynamique lancée depuis plusieurs années au sein de l’équipe, reposant sur le développement d’approches moléculaires innovantes (transcriptomique haut débit, protéomique, spectrométrie de masse) sur des espèces aquatiques dites « non modèles ». Ces méthodologies révolutionnent les approches biochimiques en écotoxicologie, puisqu'elles permettent d'identifier et de quantifier de façon spécifique des transcripts ou protéines d'intérêt directement chez les espèces cibles pour le risque environnemental. Aujourd’hui, au sein de l’équipe, ces activités sont menées via des collaborations fortes avec le CEA, l’ISA et l’IGFL. Vous devrez renforcer ces activités en y développant des activités propres à l’équipe, mais également en poursuivant les collaborations existantes et en en créant de nouvelles. Vous viendrez vous inscrire dans la construction d'un groupe de chercheurs aux thématiques fortement complémentaires, allant de l'écophysiologie animale jusqu'à la modélisation de dynamique de populations, en passant par l'étude du transfert des contaminants le long des chaines trophiques.

Vous devrez développer une thématique de recherche autour de marqueurs biochimiques pour comprendre l'impact des contaminants chimiques chez les organismes aquatiques d'eau douce, et plus particulièrement chez les invertébrés dans un premier temps. En vous appuyant sur votre formation et vos compétences dans les domaines de la biochimie et de la biologie moléculaire,vos missions seront dans le cadre de l’écotoxicologie 1 - l’acquisition de connaissances en biologie moléculaire chez les espèces d’intérêt de l’équipe, 2 - le développement de biomarqueurs nouvelle-génération, 3 -, avec un focus sur l’analyse des mécanismes impliqués dans la régulation endocrine des invertébrés aquatiques et leur adaptation à l’exposition aux contaminants en s’attachant, notamment à l’élaboration de méthodes transférables entre espèces 4 - et plus généralement l’étude des réponses moléculaires aux contaminants chez les organismes modèles de l'équipe.

Vous participerez à l'écriture et à la réalisation de projets transversaux et développerez les échanges avec les partenaires externes (CEA, ISA, …) et interne (LAMA). Vos principales activités concerneront le développement de recherche en écotoxicologie moléculaire, via le développement d'approches au niveau protéique au sein de l'équipe, mais également transcriptomique, voire métabolomique en collaboration avec des équipes d’Irstea (Antony) et des partenaires extérieurs. En collaboration avec le CEA et l'ISA, vous assurerez le développement de méthodes pour la quantification absolue de protéines d'intérêt en écotoxicologie aquatique et participerez au bon fonctionnement et au maintien du matériel de spectrométrie dédié à ces activités. Vous devrez également vous impliquer dans l'animation scientifique au sein du TR Belca et serez amené à participer aux réflexions avec les équipes du TR QUASARE sur les questions d'écotoxicologie chez le poisson. Enfin, vous devrez contribuer à la valorisation des résultats acquis, et participer à la formation par la recherche, via l’encadrement régulier d’étudiants et de post-doctorants.

Profil recherché

Titulaire d’un doctorat dans le domaine de la biologie moléculaire, vous possédez des connaissances approfondies en biochimie et chimie analytique, notamment en protéomique et spectrométrie de masse. Vous avez également une connaissance théorique sur les approches et méthodologies en génomique et transcriptomique, dans l'objectif d'alimenter les réflexions sur les méthodes protéiques. Enfin vous avez des compétences théoriques et pratiques en bio-informatique, vous permettant d’analyser et étudier de grands jeux de données de séquences. Vous avez des capacités à contribuer à l’élaboration et à participer à des programmes de recherches, maîtrisez l’anglais, êtes apte à mettre en place des études écotoxicologiques. Vous avez une capacité à travailler en équipe dans un contexte interdisciplinaire.

Le dossier est à renvoyer au plus tard le 29/08/2016.

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